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惠遠(yuǎn)Insight|納米孔測(cè)序應(yīng)用廣闊,看好高端測(cè)序設(shè)備的“中國芯”

發(fā)布日期:2021-12-09  瀏覽次數(shù):0

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Oxford Nanopore(牛津納米孔公司)近日正式登陸倫敦證券交易所,當(dāng)日市值達(dá)到67億美元。歷經(jīng)16年的發(fā)展,累計(jì)超過10億英鎊的融資,這家納米孔測(cè)序的獨(dú)角獸公司作為英國估值最高的科技公司之一,成功取得了一個(gè)重要的里程碑。納米孔測(cè)序到底為什么如此受人矚目?答案是其技術(shù)使得基因檢測(cè)在臨床應(yīng)用上變得更加廣闊。隨著應(yīng)用場景越來越明確,市場空間將越來越大,我們也非常期待國內(nèi)納米孔測(cè)序廠家能夠在這個(gè)領(lǐng)域彎道超車。


納米孔測(cè)序原理
自1975年以來,Sanger發(fā)明的雙脫氧鏈末端終止法和Gilbert發(fā)明的化學(xué)降解法相繼出現(xiàn),使得基因測(cè)序從一代測(cè)序的Sanger測(cè)序法到二代測(cè)序的邊合成邊測(cè)序再到單分子測(cè)序共經(jīng)歷了三次技術(shù)變革。
目前市場上應(yīng)用最廣的是以Illumina公司為首的二代測(cè)序技術(shù)。它的測(cè)序特點(diǎn)是使用帶有可以切除的疊氮基和熒光標(biāo)記的 dNTP 進(jìn)行合成測(cè)序,工作流程包括從建庫、橋式PCR擴(kuò)增、測(cè)序、生信分析等。由于 dNTP 上的疊氮基的存在,每個(gè)鏈每次測(cè)序循環(huán)只會(huì)合成一個(gè)堿基,由于 A、C、G、T 四種堿基所攜帶的熒光各不相同,因此讀取此時(shí)的熒光就可以得知此時(shí)的堿基類型,重復(fù)這個(gè)過程,所有堿基序列就可以完成測(cè)定了。
第三代測(cè)序技術(shù)以Pacbio平臺(tái)為首的一種集高通量、快速度、長讀長及低成本等多種優(yōu)點(diǎn)于一身的新型測(cè)序技術(shù)。它最大的特點(diǎn)是無需進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增,可直接讀取目標(biāo)序列,因此假陽性率大大減少,同時(shí)避免了堿基替換及偏置等常見 PCR 錯(cuò)誤的發(fā)生。就精準(zhǔn)度來說,第三代測(cè)序技術(shù)與第二代測(cè)序技術(shù)相比并不具有優(yōu)勢(shì),錯(cuò)誤率通常在15%左右。但隨著測(cè)序深度的加大及使用更正軟件可達(dá)到99.9%的準(zhǔn)確率, 因此第三代測(cè)序技術(shù)具有廣泛的應(yīng)用前景。
納米孔測(cè)序技術(shù)是單分子實(shí)時(shí)測(cè)序的新一代技術(shù),近期正在從研究階段,慢慢轉(zhuǎn)化到臨床應(yīng)用的開發(fā)上,其無需進(jìn)行PCR,因此避免了基因擴(kuò)增過程中產(chǎn)生的錯(cuò)誤,并且納米孔測(cè)序成本低、通量高,是分子診斷未來的主要發(fā)展方向之一。Oxford Nanopore公司作為納米孔測(cè)序最領(lǐng)先的企業(yè),其基本原理是當(dāng)納米孔充滿導(dǎo)電液時(shí),兩端加上一定電壓,分子模板通過納米孔生成可測(cè)量電流。納米孔的直徑只能容納一個(gè)核苷酸,單鏈模板就會(huì)在電場作用下依次通過納米孔而引起電流強(qiáng)度變化,通過檢測(cè)相應(yīng)的電流峰判斷堿基,實(shí)現(xiàn)實(shí)時(shí)測(cè)序。Oxford Nanopore公司的技術(shù)不需要將基因組提前打斷成數(shù)百萬個(gè)幾百個(gè)堿基長的片段,也不需要進(jìn)行文庫構(gòu)建,這使得即便使用手掌大小的測(cè)序儀也能夠快速、經(jīng)濟(jì)地讀出長達(dá)上萬個(gè)堿基,使得在精準(zhǔn)醫(yī)療方向的應(yīng)用更為廣闊。
 

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牛津納米孔測(cè)序原理圖
 
納米孔測(cè)序的應(yīng)用及市場
從基因測(cè)序產(chǎn)業(yè)全景圖來看,基因測(cè)序產(chǎn)業(yè)鏈主要包括了上游儀器、中游服務(wù)提供商以及下游終端應(yīng)用三個(gè)環(huán)節(jié),產(chǎn)業(yè)鏈看似簡單,但是其下游終端應(yīng)用涉及領(lǐng)域覆蓋面非常廣,既包括醫(yī)療領(lǐng)域的人體基因組、人體微生物基因組以及基礎(chǔ)研究領(lǐng)域,還包括非醫(yī)療領(lǐng)域的環(huán)境治理、石油存儲(chǔ)探測(cè)、農(nóng)牧業(yè)配種等。從產(chǎn)業(yè)鏈整體上看,產(chǎn)業(yè)鏈上游的基因測(cè)序儀及配套試劑是整個(gè)產(chǎn)業(yè)鏈壁壘最高的部分。鑒于成本和技術(shù)難度等問題,國內(nèi)進(jìn)行測(cè)序設(shè)備研發(fā)的企業(yè)數(shù)量并不多,幾乎都被國外巨頭例如:Illumina、賽默飛、羅氏等企業(yè)壟斷。
全球基因測(cè)序行業(yè)增長迅速,2021年全球基因測(cè)序市場將達(dá)176億美元,中國市場將超200多億元。隨著測(cè)序技術(shù)進(jìn)步,基因測(cè)序儀也朝著測(cè)序成本低,檢測(cè)速度快,儀器愈加便攜小巧的趨勢(shì)發(fā)展。
一代測(cè)序儀設(shè)備成本極高,因其通量極低,要獲得大量序列數(shù)據(jù)的花費(fèi)十分驚人。具有里程碑意義的人類基因組計(jì)劃是通過一代測(cè)序完成的。
二代測(cè)序儀設(shè)備為百萬元級(jí),對(duì)于小型實(shí)驗(yàn)室及科研院所來說采購門檻過高,其高通量芯片單次運(yùn)行成本較高,在臨床端常常需要湊樣本來降低單位運(yùn)行成本,且測(cè)序時(shí)間較長,因此其在臨床機(jī)構(gòu)的推廣相對(duì)困難,也難以滿足急性疾病診斷的需求。
納米孔測(cè)序具有低成本、高通量、非標(biāo)記等優(yōu)勢(shì),有利于促進(jìn)生命科學(xué)的發(fā)展,為個(gè)體化醫(yī)療帶來革命,并將人類疾病臨床診斷及治療帶入新的時(shí)代,可以應(yīng)用于從癌癥、感染性疾病、生殖健康、血液篩查等臨床應(yīng)用;到科研、檢驗(yàn)檢疫、農(nóng)業(yè)和漁業(yè)以及食品安全等眾多領(lǐng)域。隨著技術(shù)的成熟和產(chǎn)品的落地,納米孔測(cè)序市場將進(jìn)一步擴(kuò)大,未來有望突破千億級(jí)別。
 
堅(jiān)持看好高端測(cè)序設(shè)備的“中國芯”
惠遠(yuǎn)資本持續(xù)關(guān)注上游測(cè)序儀器行業(yè),通過深入的行業(yè)和技術(shù)研究,尋找細(xì)分賽道中的領(lǐng)先企業(yè)。我們很榮幸近期投資了國內(nèi)領(lǐng)先的納米孔測(cè)序儀器企業(yè) – 今是科技。今是科技突破了主要技術(shù)障礙,擁有納米孔測(cè)序儀完全自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)。公司通過豐富技術(shù)儲(chǔ)備和國際化商業(yè)視野,致力于讓基因測(cè)序成為精準(zhǔn)醫(yī)療的常規(guī)應(yīng)用,不斷推動(dòng)納米孔測(cè)序儀的臨床應(yīng)用。

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今是科技構(gòu)建了自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的創(chuàng)新邊合成邊測(cè)序技術(shù)路線,可以大幅度降低測(cè)序成本、提升數(shù)據(jù)質(zhì)量和提高測(cè)序效率。公司儲(chǔ)備了多學(xué)科高度集成的尖端技術(shù),涵蓋了包括生化,有機(jī)合成,材料,MEMS加工,IC芯片,機(jī)械制造,機(jī)器學(xué)習(xí)算法等在內(nèi)的眾多專業(yè)領(lǐng)域,具有極高的技術(shù)開發(fā)壁壘。今是科技組建了研發(fā)實(shí)力超群的團(tuán)隊(duì),經(jīng)過前期努力,已在多個(gè)關(guān)鍵的技術(shù)領(lǐng)域取得了豐碩成果,相應(yīng)的技術(shù)積累也為公司打造性能卓越的目標(biāo)產(chǎn)品和構(gòu)筑未來發(fā)展護(hù)城河奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ),包括了核苷酸的準(zhǔn)確識(shí)別、聚合酶的改造和優(yōu)化、高效檢測(cè)系統(tǒng)、高性能芯片開發(fā)、超級(jí)電容電極的制備技術(shù)等。公司測(cè)序儀開發(fā)的多個(gè)關(guān)鍵技術(shù)環(huán)節(jié)上都取得了突破性的進(jìn)展,已經(jīng)完成了工程樣機(jī)的開發(fā),會(huì)先推出科研端的納米孔測(cè)序儀,且在未來全面進(jìn)軍臨床市場。
我們相信,測(cè)序儀作為在國內(nèi)“十四五”大背景下高端精密儀器的發(fā)展方向,具有極高的技術(shù)壁壘。今是科技具有強(qiáng)大的自主研發(fā)能力,結(jié)合團(tuán)隊(duì)跨學(xué)科的技術(shù)積累,不斷完善納米孔測(cè)序解決方案,開拓過往測(cè)序技術(shù)不能覆蓋的痛點(diǎn)市場?;葸h(yuǎn)資本將全力支持公司發(fā)展,通過產(chǎn)業(yè)賦能,攜手創(chuàng)造價(jià)值。
 
關(guān)于惠遠(yuǎn)資本
惠遠(yuǎn)資本成立于2019年,由專業(yè)投資團(tuán)隊(duì)與國資共同設(shè)立,是一家專注于生物醫(yī)藥和醫(yī)療器械領(lǐng)域長期投資的新銳醫(yī)療投資機(jī)構(gòu),系統(tǒng)布局細(xì)分賽道中具有突破性和創(chuàng)新性技術(shù)的優(yōu)質(zhì)標(biāo)的。與多家產(chǎn)業(yè)機(jī)構(gòu)建立深入合作關(guān)系,堅(jiān)持以“產(chǎn)業(yè)賦能+資本助力”為投資策略,旨在為投資者帶來長期穩(wěn)健的投資回報(bào)。
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