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惠遠資本Portfolio|普瑞基準攜手協(xié)和華西在Nature子刊發(fā)表中國最大規(guī)模的上皮性卵巢癌同源重組缺陷研究成果

發(fā)布日期:2023-06-02  瀏覽次數(shù):0

近日,惠遠資本被投企業(yè)普瑞基準與北京協(xié)和醫(yī)院吳鳴教授、潘凌亞教授和梁智勇教授、四川大學華西二院尹如鐵教授共同合作開展的EOC-HRD項目研究成果(“HRD Effects on First-line Adjuvant Chemotherapy and PARPi Maintenance Therapy in Chinese Ovarian Cancer Patients”)發(fā)表在Nature子刊npj Precision Oncology上,該研究是迄今國內(nèi)最大規(guī)模的上皮性卵巢癌(EOC)人群同源重組缺陷狀態(tài)研究(N=463)。該回顧性研究包括兩個隊列:一線輔助化療(FACT)隊列一線PARPi維持治療(FPMT)隊列,基于中國人群數(shù)據(jù),建立檢測HRD score的方法學(普瑞基準昂可迪Pro產(chǎn)品),并驗證HRD狀態(tài)(HRD status)與FACT和FPMT療效的相關(guān)性。



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圖1. 研究成果在Nature子刊npj Precision Oncology在線發(fā)表

HRD score方法學建立


研究中采用的“Precision Human HRD Assay”包括兩個部分:HRD score和36個DDR基因(28個HRR基因和8個非HRR基因)檢測。建立的HRD score方法學與myChoice-Plus、全基因組HRD score和全外顯+骨架探針HRD score相比,R2均大于0.98,表明該HRD score的方法學可以準確地評估腫瘤的HRD狀態(tài)。



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圖2. HRD score方法學與其他方法學對比


HRD score閾值訓練集共包含199名BRCA1/2雙等位基因功能喪失(BILOF)卵巢癌患者,包括來自FACT隊列的130名BRCA1/2 BILOF患者,來自FPMT隊列的34名BRCA1/2 BILOF患者,以及來自普瑞基準常規(guī)基因檢測服務的35名BRCA1/2 BILOF患者,他們符合FACT和FPMT隊列的共有入排標準。在HRD score閾值訓練集中,HRD score的第5百分位數(shù)為41.9,預測BRCA1/2 BILOF的敏感性為95%。因此,如果HRD score≥42或BRCA1/2發(fā)生突變,則腫瘤被定義為HRD陽性。



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圖3. 根據(jù)BRCA1/2雙等位基因功能喪失確立的HRD score閾值

HRD狀態(tài)對一線輔助化療療效的預測效果

研究結(jié)果顯示,在FACT隊列中,BRCA1/2突變組中位PFS為17.7個月,BRCA1/2野生型組中位PFS為12.1個月(HR, 0.629; 95% CI, 0.487-0.814; P=0.003);HRD陽性組中位PFS為15.6個月,HRD陰性組中位PFS為9.4個月(HR, 0.688; 95% CI, 0.526-0.899; P=0.003);并且在BRCA1/2野生型亞組中,HRD陽性患者的PFS延長了3.6個月(13個月vs. 9.4個月; HR, 0.769; 95%CI, 0.578-1.023; P=0.071)。以上結(jié)果表明BRCA1/2突變和HRD陽性均可顯著延長PFS,并且HRD score極大比例增加了一線含鉑化療高獲益人群(35%→77%),在BRCA1/2野生型患者中,HRD陽性患者獲益也有明顯提升。

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圖4. HRD狀態(tài)與化療相關(guān)PFS和OS的相關(guān)性


HRD狀態(tài)對一線PARPi維持治療療效的預測效果


研究結(jié)果顯示,在FPMT隊列中,BRCA1/2突變是PFS的強預測因子(NA vs. 20個月; HR, 0.423; 95%CI, 0.198-0.906; P=0.023,但對于OS并未達到類似的預測效果(NA vs. NA; HR, 0.592; 95% CI, 0.141-2.477; P=0.467;而HRD陽性組PFS(NA vs. 12個月; HR, 0.438; 95% CI, 0.201-0.957; P=0.033和OS(NA vs. NA; HR, 0.12; 95% CI, 0.029-0.505; P=0.001)都有顯著的提升;此外,在BRCA1/2野生型亞組中,HRD陽性在OS中也顯示出顯著的獲益。以上結(jié)果表明BRCA1/2突變和HRD陽性均顯著延長PFS,但HRD score極大比例增加了卵巢癌一線PARPi維持治療獲益人群(47%→75.9%);并且相對于BRCA1/2突變狀態(tài),HRD狀態(tài)可能是OS的更好預測因子。

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圖5. HRD狀態(tài)與PARPi維持治療相關(guān)PFS和OS的相關(guān)性


BRCA1/2野生型亞組中,相對于HRR,HRD狀態(tài)是更好的療效預測因子

研究對于BRCA1/2野生型亞組的最佳療效預測因子進行了探索,結(jié)果顯示,在FACT隊列中,HRD狀態(tài)、HRR28和HRR14都是PFS令人滿意的預測因子,但沒有達到統(tǒng)計學意義,對于OS,HRR28和HRR14的表現(xiàn)略差于HRD狀態(tài),但也未達到統(tǒng)計學意義;在FPMT隊列中,HRR14和HRR28均無法有效地與PFS和OS相關(guān)聯(lián),而HRD狀態(tài)則是PFS和OS的強有力的預測因子,尤其是OS(有統(tǒng)計學意義。這些結(jié)果表明,在BRCA1/2野生型亞組中,HRD狀態(tài)相比HRR基因突變狀態(tài)能更好地預測療效。

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圖6. BRCA1/2野生型亞組HRD和HRR療效預測效果比較


專家點評


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北京協(xié)和醫(yī)院   吳 鳴 教授

該項研究是中國首個最大規(guī)模的EOC患者的HRD研究(N=463),為中國HRD陽性患者使用PARP抑制劑提供了臨床證據(jù)。國內(nèi)HRD檢測一直缺乏大型研究的有力臨床證據(jù),本研究填補了國內(nèi)這一空白,是國內(nèi)HRD檢測的療效驗證的重要成果,為中國患者HRD狀態(tài)明確提供了經(jīng)過嚴格性能驗證及大型臨床研究療效驗證的的可靠檢測產(chǎn)品。

在本研究中,將Precision Human HRD Assay分別與WES+Backbone、WGS、甚至是已上市產(chǎn)品myChoice-Plus進行了比較,均達到高度的一致性。這對于中國的EOC患者來說,不僅意味著HRD檢測從“照搬國外”變成“本土可及”,而且從WES或WGS到HRD Panel的“瘦身”為廣大的患者極大程度地降低了檢測成本。

本研究的中國特色不僅體現(xiàn)在BRCA1/2及HRD的陽性率方面,也表現(xiàn)在HRD評分閾值定義方面。一方面,在一線治療隊列中BRCA1/2的陽性率達到35%,高于國外基于高加索人群的報道數(shù)據(jù);HRD的陽性率也高于國外報道的48%-50%,提示在EOC患者中,體現(xiàn)基因組不穩(wěn)定性的BRCA1/2突變和HRD現(xiàn)象存在人種差異性。另一方面,鑒于HRD評分閾值判定與不同人群、不同癌種、不同適應證有關(guān)。本研究聯(lián)合BRCA1甲基化檢測鑒定出199例BRCA1/2雙等位失活的樣本,進行HRD評分的閾值訓練。據(jù)悉,這是目前國內(nèi)已報道研究中,針對卵巢癌HRD評分閾值訓練的最大集合,且該閾值后續(xù)分別在一線含鉑化療及一線PARPi維持隊列中得到了良好的驗證,這為中國卵巢癌患者在一線治療的場景中的治療選擇提供了更多的可能性。期待后續(xù)普瑞基準的HRD檢測可以在不同癌種如胰腺癌、乳腺癌、前列腺癌中建立屬于中國人群自己的HRD評分閾值。