近日,惠遠資本被投企業(yè)普瑞基準與北京協(xié)和醫(yī)院吳鳴教授、潘凌亞教授和梁智勇教授、四川大學華西二院尹如鐵教授共同合作開展的EOC-HRD項目研究成果(“HRD Effects on First-line Adjuvant Chemotherapy and PARPi Maintenance Therapy in Chinese Ovarian Cancer Patients”)發(fā)表在Nature子刊npj Precision Oncology上,該研究是迄今國內(nèi)最大規(guī)模的上皮性卵巢癌(EOC)人群同源重組缺陷狀態(tài)研究(N=463)。該回顧性研究包括兩個隊列:一線輔助化療(FACT)隊列和一線PARPi維持治療(FPMT)隊列,基于中國人群數(shù)據(jù),建立檢測HRD score的方法學(普瑞基準昂可迪Pro產(chǎn)品),并驗證HRD狀態(tài)(HRD status)與FACT和FPMT療效的相關(guān)性。
研究中采用的“Precision Human HRD Assay”包括兩個部分:HRD score和36個DDR基因(28個HRR基因和8個非HRR基因)檢測。建立的HRD score方法學與myChoice-Plus、全基因組HRD score和全外顯+骨架探針HRD score相比,R2均大于0.98,表明該HRD score的方法學可以準確地評估腫瘤的HRD狀態(tài)。
HRD score閾值訓練集共包含199名BRCA1/2雙等位基因功能喪失(BILOF)卵巢癌患者,包括來自FACT隊列的130名BRCA1/2 BILOF患者,來自FPMT隊列的34名BRCA1/2 BILOF患者,以及來自普瑞基準常規(guī)基因檢測服務的35名BRCA1/2 BILOF患者,他們符合FACT和FPMT隊列的共有入排標準。在HRD score閾值訓練集中,HRD score的第5百分位數(shù)為41.9,預測BRCA1/2 BILOF的敏感性為95%。因此,如果HRD score≥42或BRCA1/2發(fā)生突變,則腫瘤被定義為HRD陽性。
HRD狀態(tài)對一線PARPi維持治療療效的預測效果
研究結(jié)果顯示,在FPMT隊列中,BRCA1/2突變是PFS的強預測因子(NA vs. 20個月; HR, 0.423; 95%CI, 0.198-0.906; P=0.023),但對于OS并未達到類似的預測效果(NA vs. NA; HR, 0.592; 95% CI, 0.141-2.477; P=0.467);而HRD陽性組PFS(NA vs. 12個月; HR, 0.438; 95% CI, 0.201-0.957; P=0.033)和OS(NA vs. NA; HR, 0.12; 95% CI, 0.029-0.505; P=0.001)都有顯著的提升;此外,在BRCA1/2野生型亞組中,HRD陽性在OS中也顯示出顯著的獲益。以上結(jié)果表明BRCA1/2突變和HRD陽性均顯著延長PFS,但HRD score極大比例增加了卵巢癌一線PARPi維持治療獲益人群(47%→75.9%);并且相對于BRCA1/2突變狀態(tài),HRD狀態(tài)可能是OS的更好預測因子。
圖5. HRD狀態(tài)與PARPi維持治療相關(guān)PFS和OS的相關(guān)性
研究對于BRCA1/2野生型亞組的最佳療效預測因子進行了探索,結(jié)果顯示,在FACT隊列中,HRD狀態(tài)、HRR28和HRR14都是PFS令人滿意的預測因子,但沒有達到統(tǒng)計學意義,對于OS,HRR28和HRR14的表現(xiàn)略差于HRD狀態(tài),但也未達到統(tǒng)計學意義;在FPMT隊列中,HRR14和HRR28均無法有效地與PFS和OS相關(guān)聯(lián),而HRD狀態(tài)則是PFS和OS的強有力的預測因子,尤其是OS(有統(tǒng)計學意義)。這些結(jié)果表明,在BRCA1/2野生型亞組中,HRD狀態(tài)相比HRR基因突變狀態(tài)能更好地預測療效。
圖6. BRCA1/2野生型亞組HRD和HRR療效預測效果比較
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